学校建有国家重点实验室1个、国家工程技术研究中心1个、国家地方联合工程实验室1个、省部共建国家重点实验室培育基地1个、教育部或农业部重点实验室10个、教育部工程研究中心3个、"111计划"创新引智基地3个、国家野外科学观测试验站2个、农业部科学观测实验站2个、国土资源部野外基地2个、国家大学科技园1个、重庆市重点实验室12个、重庆市工程实验室（工程技术研究中心）25个、教育部人文社科重点研究基地1个、文化部公共文化研究基地1个、国家体育总局重点实验室（共建）1个、重庆市人文社会科学重点研究基地13个。