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三峡工程从论证到建设，一直质疑不断。其中关于三峡基金的质疑颇多，最近媒体报道中央巡视组巡视发现三峡工程存有招投标暗箱操作、工程建设项目分包等可能存在腐败的行为，尤其是三峡集团公司爆出董事长曹广晶、总经理陈飞双双被免职的惊人消息后，再一次引发了人们对三峡基金使用的质疑。

三峡基金，即三峡工程建设基金，是国务院为筹集三峡工程建设所需资金而设的专项基金。其来源，除了部分是葛洲坝电厂发电利润，主要是通过对居民用电加价来筹集的。

将葛洲坝电厂上缴利润转作三峡基金，从1984年即已开始。到1993年，国家计委、财政部、电力部、国家物价局联合发出通知，以提高葛洲坝电厂上网电价筹集三峡资金,从1993年l月l日起,对葛洲坝电厂上网电价在现行电价基础上每年提价一分，分4年到位，每千瓦时共提价4分。1993年的提价按1992年收受电量164.6亿千瓦时执行，提价额1.646亿元，其中华中电网1.535亿元（湖北电网1.184亿元、河南电网1010万元、湖南电网2070万元、江西电网430万元），华东电网1110万元。1997年起，葛洲坝电厂上网电价又多次提高，但到底收了多少钱，无从而知，只有一个测算，估计1993－2009年约100亿元。

居民用电加价，有过多次。首先是从1992年起每度电征收3厘钱（除国家扶贫的贫困地区的农业排灌、县及县以下集资建设自行管理的孤立电网以外的各类用电量，西藏自治区例外不收），1994年改为每度电4厘钱，自1996年2月1日起，在三峡工程直接受益地区和经济发达地区的十六个省、直辖市（湖北、湖南、河南、江西、广东、福建、浙江、江苏、上海、安徽、山东、北京、天津、河北、山西、四川）每度电提高到7厘钱征收。1997年3月25日起又执行新的标准，八省、市再加收6－8厘（江苏、浙江、湖北、上海市由每度电7厘提高到1.5分，安徽、湖南、河南、江西由7厘提高到1.3分），四川省和重庆市每度电新加征3厘。2003年1月1日起开始执行新的标准，湖北免征，湖南、江西、河南分别调整为每度电0.98分、1.12分、1.24分钱，华东区不变。

三峡基金的征收管理办法，从财政部工交司工作人员陈宗法（公开资料显示曾为工交司副处长）1995年发表的文章透露出来的信息看，应该是由该司起草、代拟的。征收数额，是根据国家确定的电量计划，于每年年初由电力部门与财政部门、计划部门商定下达各省、市、自治区征收三峡基金的年度计划（或年度调整计划）。1992年、1993年、1994年下达的三峡基金征收计划分别为7.2亿元、15.7亿元、19.3亿元。在征缴管理上，明确规定三峡基金由各地电力企业负责代征，由财政部驻各省、市、自治区财政厅(局)中央企业财政驻厂员处（简称“中企处”）及其下属机构负责监缴。“中企处”后来似乎改称为“专员办”（财政部驻各地财政监察专员办事处）。

三峡基金刚开始征缴时似乎并不顺利，有些省份曾要求免交甚至拒交。为此，出台了严厉的通知，要求“不得以任何理由减免或缓征”，“对1992年和1993年1至5月份应交而未交的‘三峡基金’，必须在今年（指1993年）6月底以前彻底交清，不得拖欠。否则，要追究有关部门主要领导人的责任。”在严厉督责下，征缴变得顺利，到1993年底，累计入库18.48亿元，完成应征数的71%，其中完成征收任务80%以上的有14个省、区。1994年，征收工作进展得更加理想，到9月底入库16亿元，完成当年计划的84%。按累计数计算，1992年到1994年9月，应上交三峡基金37.4亿元，实际入库35.2亿元，完成任务的94%。“与此同时，财政部门累计拨付三峡基金35亿元。这不仅保证了三峡工程前期准备工作的资金需求，而且进入1994年9月份还出现了能预付工程款、资金有结余的现象，开创了基建史上特大型工程资金供应的奇迹。因此，无论是国务院领导、国家有关部门，还是三峡公司、三峡移民开发局都非常满意。”（陈宗法：《关于财政参与基金管理的若干思考：从三峡工程建设基金看财政管理》，《财政研究》1995年第4期）然而，问题也不是没有，在有些省份，因为有些企业经营出现困难而欠缴电费，连带也就欠缴三峡基金，出现了电力部门垫付基金款的情况。

三峡基金受到的最大质疑是信息不公开。多次提价和加价，到底总共收了多少钱，却没有公开信息。2008年5月，《中华人民共和国政府信息公开条例》付诸实施，公民的知情权有了法律依据。2009年10月至2010年4月，创建“三峡观察”网（www.sanxia2008.org）的任星辉分别向财政部、国务院三峡工程建设委员会、中国长江三峡集团公司、国资委、国家电网申请公开三峡工程建设资金的详细收支数据，但一无所获，向财政部申请行政复议不予受理，向北京中院提起行政诉讼也不予受理，向北京高院提起上诉亦被驳回。

关于各省历年所收三峡基金的数额及全国总额，官方没有公开过，目前只能从有关知情者在文章中透露的信息了解到一鳞半爪。财政部上海专员办工作人员发表的文章中透露，2004年上海实际监缴入库的三峡基金为7.10亿元。全国总数，1992－1994年的情况如上文。三峡总公司财务部主任杨亚2000年发表的文章中透露，根据三峡工程总体筹资方案，三峡工程动态资金需求测算为2039亿元人民币，三峡基金预计1993－2009年可征收900亿到1000亿元。审计署于2006年对三峡工程进行了审计，审计结果显示，截至2005年底，征收的三峡基金为621.38亿元。

三峡总公司主办的《中国三峡建设年鉴》透露，截止2008年底，三峡总公司累计筹集工程建设资金2042.30亿元，其中三峡基金1070.96亿元；自开工到2009年底，三峡专项基金累计完成1115.661252亿元，其中2008、2009年实际分别完成117.0258亿元和117.123亿元。而财政部提供的数据，2008年决算是三峡基金收入202.59亿元、支出204.56亿元，2009年决算三峡基金收入195.98亿元、支出184.50亿元。2012年4月，三峡集团公司总经理陈飞透露三峡基金总数是1378亿元。

三峡基金受到的另一个质疑是2009年三峡工程完工后三峡基金本该停止征收，但实际上却换个名称继续征收。2009年12月31日，财政部印发《国家重大水利工程建设基金征收使用管理暂行办法》，承认重大水利基金是利用三峡基金停征后的电价空间设立，规定：“三峡工程建设基金向重大水利基金平稳过渡，保持三峡工程建设基金现行征收政策基本不变”，本办法自2010年1月1日起执行，三峡基金同时停止征收。但是，在财政部公布的“2010年中央政府性基金收入预算表”中仍有三峡基金，预算收入10.00亿元、支出44.90亿元，而决算情况是收入59.15亿元、支出94.33亿元。这意味着，实际上2010年三峡基金仍在征收。同时增加的重大水利基金，2010、2011年决算收入分别为210.49亿元、275.73亿元，相较于三峡基金2009年决算收入195.98亿元均有增加。

三峡基金受到质疑的还有其他多个方面，比如三峡工程建设主要是由民众出钱，但建成后民众却未见受益，电费负担并没有相应降低；三峡基金的使用是否存在腐败现象；等等。也许，随着三峡集团公司董事长、总经理双双被免职，是否存在腐败、腐败有多严重等问题，最终会有一个答案。但愿答案不会来得太晚。