东北财经大学坚持基础研究引领学术前沿“发声”、应用研究扎根实践“管用”的“顶天立地”科研与社会服务工作方针。现有教育部人文社会科学重点研究基地1个，财政部共建基地1个，与地方政府共建的自贸区研究院1个，其他省级以上重点研究机构及科研平台15个（包括辽宁省协同创新中心1个、辽宁省人文社会科学重点研究基地9个，辽宁省高校重点实验室2个，省级其他类别重点研究机构3个），校级科研机构36个；有辽宁省省级创新团队13个，初步建立了以人文社科重点研究基地、辽宁省协同创新中心以及部省共建试点基地为代表的智库新模式。学校出版社是全国百佳图书出版单位，国家一级出版社。